¿Puede una empresa descontar parte del salario de una persona trabajadora que llega tarde? Es una duda frecuente, especialmente desde que el registro horario es obligatorio y permite comprobar con exactitud las horas de entrada y salida.
El control horario se ha convertido en una herramienta clave para gestionar la jornada laboral, pero también en un posible punto de conflicto entre empresas y empleados: ¿qué ocurre con esos minutos o incluso horas no trabajadas por impuntualidad?
Recientemente, un caso llegó hasta el Tribunal Supremo y ha sentado un precedente importante. En este post te contamos en qué consiste esta sentencia, qué implicaciones tiene para empresas y trabajadores, y cómo gestionar correctamente el control horario para evitar problemas legales o conflictos en la nómina.
¿Por qué es noticia? Te explicamos todo sobre la sentencia del Tribunal Supremo sobre impuntualidad y salario.
El origen de esta noticia está en un conflicto laboral real: una empresa del sector Contact Center implantó un sistema de control horario y empezó a descontar de la nómina de algunos empleados el tiempo que llegaban tarde. Los sindicatos consideraron que se trataba de una “multa de haber” encubierta —una sanción económica prohibida por el artículo 58.3 del Estatuto de los Trabajadores— y llevaron el caso a los tribunales.
El Tribunal Supremo, en su Sentencia STS 582/2021, de 27 de mayo de 2021, resolvió finalmente la cuestión. Según el Alto Tribunal, sí puede descontarse salario por impuntualidad, ya que no es una sanción, sino la consecuencia lógica de no haber prestado servicios durante ese tiempo.
El argumento clave está en el artículo 26.1 del Estatuto de los Trabajadores, que establece que el salario corresponde a la prestación de servicios laborales efectivamente realizada (o a los descansos computables como tiempo trabajado). Dicho de otro modo: si una persona trabajadora llega tarde y no presta servicio durante ese período, no devenga salario por esos minutos u horas.
El Supremo dejó claro que este descuento es legal siempre que sea proporcional al tiempo no trabajado y no se convierta en una sanción encubierta o duplicada junto a otras medidas disciplinarias.
Jurisprudencia que matiza. Cuando la empresa no advierte ni sanciona, no puede reclamar.
Aunque esta sentencia del Supremo reconoce el derecho de la empresa a descontar del salario el tiempo de impuntualidad registrada, no significa que todo valga ni que se pueda aplicar de forma arbitraria.
Existe jurisprudencia que protege los derechos de las personas trabajadoras cuando la empresa no gestiona correctamente estos retrasos. Por ejemplo, en el caso de una optometrista que trabajaba en una clínica oftalmológica con horario partido, la empresa acumuló durante diez años 176 retrasos en la hora de entrada. Sin embargo, nunca le comunicó advertencia alguna, ni apercibimiento verbal o escrito.
Cuando la empresa decidió despedirla por esas impuntualidades (y otros motivos añadidos), el Juzgado de lo Social nº 6 de Oviedo declaró el despido improcedente. El tribunal consideró que la empresa había tolerado durante años esa conducta sin aplicar medidas disciplinarias ni dejar constancia de las faltas, de modo que no podía justificar la sanción más grave del despido.
La resolución fue confirmada por el Tribunal Superior de Justicia de Asturias.
Este ejemplo demuestra que para que la empresa pueda actuar con seguridad jurídica —sea descontando salario o aplicando sanciones— debe haber un registro claro de la jornada y una comunicación formal de las incidencias. La gestión de la puntualidad no puede improvisarse ni aplicarse de manera irregular o desproporcionada.
¿Qué implica esta sentencia para las empresas y las personas trabajadoras?
La sentencia del Tribunal Supremo aclara un punto esencial: las empresas pueden descontar de la nómina la parte proporcional del salario correspondiente al tiempo en que la persona trabajadora no ha prestado servicios por llegar tarde.
Este descuento no se considera una sanción encubierta (o “multa de haber”) siempre que sea proporcional y esté correctamente registrado. Es decir, la base legal está en que el salario retribuye únicamente el tiempo de trabajo efectivo o los descansos computables como tiempo trabajado.
Sin embargo, la sentencia también deja claro que esta facultad no es un cheque en blanco para la empresa. Es imprescindible:
- Informar al trabajador o trabajadora de la política de control horario y de las consecuencias de la impuntualidad.
- Registrar formalmente los retrasos mediante un sistema fiable y accesible.
- Diferenciar entre el descuento salarial proporcional y las sanciones disciplinarias previstas en convenio o normativa interna.
En otras palabras, la empresa puede aplicar ambos mecanismos —descuento proporcional y sanción disciplinaria— siempre que no duplique penalizaciones de forma indebida y se respeten los procedimientos previstos.
Para las personas trabajadoras, la sentencia refuerza la obligación de cumplir con el horario acordado y la importancia de fichar correctamente. A la vez, garantiza que cualquier práctica empresarial debe ser transparente, proporcional y ajustada a derecho.
El registro horario como prueba ante inspecciones o juicios.
El registro horario obligatorio no solo sirve para controlar la jornada de trabajo, sino que se convierte en una prueba clave ante posibles conflictos o inspecciones laborales.
Para poder descontar del salario el tiempo de impuntualidad de forma legal, la empresa debe contar con un sistema de registro horario fiable, objetivo y accesible. Este registro permitirá demostrar de manera clara:
- La hora real de entrada y salida de cada persona trabajadora.
- La existencia de retrasos o ausencias parciales.
- La proporcionalidad del descuento aplicado en la nómina.
En caso de inspección de trabajo o de demanda judicial, el registro horario actúa como prueba documental para justificar tanto los pagos como los eventuales descuentos.
Además, la ley exige conservar estos registros durante cuatro años y garantizar su disponibilidad para la plantilla y la Inspección de Trabajo.
Contar con un sistema sólido y bien gestionado reduce riesgos legales, evita sanciones administrativas y previene conflictos con la plantilla, al ofrecer total transparencia y trazabilidad.
👉Si quieres más información, te recomendamos leer el post: La nueva ley de control horario 2025: qué cambia y cómo adaptarse

¿Por qué no basta con plantillas en Excel o sistemas manuales?
Aunque algunas empresas todavía utilizan plantillas en Excel o métodos manuales para controlar el horario, estos sistemas presentan limitaciones importantes que pueden generar problemas legales y organizativos.
En primer lugar, carecen de trazabilidad fiable: es fácil que se modifiquen datos sin dejar rastro, lo que compromete su valor como prueba ante inspecciones o tribunales. Además, estos formatos no suelen recoger datos como la geolocalización o la hora exacta y certificada del fichaje, lo que dificulta demostrar la puntualidad real. Por este motivo, estos sistemas manuales no suelen ser válidos como prueba en un proceso judicial.
También tienen mayor riesgo de errores humanos en la introducción de datos, solapamientos o cálculos incorrectos de la jornada y las horas extras. Esto puede derivar en sanciones o reclamaciones laborales si la Inspección detecta irregularidades.
Por otro lado, no cumplen con los estándares actuales de protección de datos: almacenar información personal en hojas de cálculo sin controles de acceso adecuados puede vulnerar la normativa vigente.
Además, la ley exige que el registro diario de jornada sea fiable, objetivo y accesible, tal y como establece el artículo 34.9 del Estatuto de los Trabajadores, modificado por el Real Decreto-ley 8/2019. Sin embargo, estas plantillas no ofrecen garantías para cumplir con esos requisitos legales, ya que pueden manipularse fácilmente, carecen de controles de acceso seguros y dificultan el cumplimiento de la obligación de conservar y presentar los registros ante Inspección de Trabajo o a la propia plantilla.
En definitiva, confiar en métodos manuales o en plantillas poco seguras no solo aumenta el riesgo de sanciones, sino que complica la gestión interna y reduce la transparencia con la plantilla.
👉 En Gestión Presencia ponemos a tu disposición algunas plantillas gratuitas para el registro de control horario y de vacaciones. Pero te recordamos que su uso debe ser como punto de partida mientras das el paso a una solución definitiva, ya que no cumplen la legislación ante inspecciones.
Ventajas de un software de control horario integral como PRESENCIA.
Para cumplir con la normativa, evitar sanciones y gestionar de forma eficiente la jornada laboral, un software de control horario profesional como PRESENCIA ofrece ventajas claras y prácticas frente a sistemas manuales o incompletos. Con PRESENCIA, las empresas disponen de:
- Registro horario legal y homologado, accesible para Inspección de Trabajo y para la plantilla.
- Fichaje multiplataforma desde web, móvil o app con geolocalización, que permite controlar la jornada en teletrabajo o en movilidad.
- Generación automática de informes y reportes para inspecciones o auditorías internas.
- Gestión completa de ausencias y vacaciones, con planificación y aprobación online.
- Gestión documental de empleados centralizada: contratos, nóminas, acuerdos de confidencialidad (NDAs), modelo 145, etc.
- Firma de documentos directamente desde la web o el móvil, evitando papeleo físico y agilizando procesos.
- Subida de justificantes de ausencias por parte de la plantilla y bandeja de notificaciones para mantener la comunicación fluida.
- Almacenamiento seguro y cumplimiento de la ley de protección de datos, garantizando la privacidad y la trazabilidad.
Con un sistema integral como PRESENCIA, las empresas pueden demostrar fácilmente la puntualidad o la impuntualidad, aplicar descuentos proporcionales de forma legal y transparente, y evitar sanciones o conflictos. Todo ello mientras simplifican la gestión de su equipo y mejoran la organización interna.

Garantiza la puntualidad y seguridad jurídica en tu empresa.
La reciente sentencia del Tribunal Supremo confirma que es legal descontar del salario el tiempo no trabajado por impuntualidad, siempre que se haga de forma proporcional, justificada y correctamente registrada. Pero también demuestra la importancia de contar con un sistema fiable que permita documentar cada entrada y salida, evitando así sanciones, errores o conflictos laborales.
Con PRESENCIA puedes gestionar el control horario de tu plantilla de forma sencilla, legal y segura. Además de registrar la jornada con total trazabilidad, podrás gestionar ausencias y vacaciones, centralizar la documentación laboral, firmar contratos y acuerdos online, y mantener una comunicación fluida con tu equipo.
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